云南中医药大学图书馆始建于1961年，经过60年的建设与发展，已形成了以中医药文献为主，民族医药文献为特色的云南省最大、最全、最专业的中医药民族医药图书馆。

　　图书馆位于云南中医药大学呈贡校区中心位置，建筑体名为“翰墨楼”，馆舍面积16000平方米，有5个集藏、借、阅一体的图书阅览区，2个电子阅览室，1个中心机房，2个基藏、样本书室，1个古籍书库和陈列室，1个中医西学博物馆。全馆阅览座位数2291个，电子阅览座位数442个，共计2733个。

　　在馆藏的纸质文献中，在馆藏的纸质文献中，医学类文献约占42%，其中中医药、民族医药类文献约占20%，馆藏的1.8万册中医药文献古籍中，与云南民族医药相关的特色古籍占到近1万册，特别是以纳西东巴经、傣族贝叶经、彝族毕摩经等为代表的云南少数民族医药古籍文献是目前云南省图书馆中收藏最全、最多的，涵盖了医经、本草、方书、医史、针灸、养生、医案医话及临床等各科，拥有《性原广嗣》《彻胜八编》《补注洗冤集录》《镌尹真人性命圭旨书》《滇南草本》等孤本、珍本以及珍贵古籍共39种，进入国家古籍普查目录1420种、13102册。

　　现有纸本藏书110.3万册，纸质期刊359种，馆藏线装古籍图书1.8万册，电子资源总量61.78TB，拥有中外文数据库50个，电子图书359万册，电子期刊248万册，学位论文99万册，音视频16万小时。

　　“中医西学博物馆”作为目前世界唯一一座的中医西学博物馆，始建于2012年，建有欧洲针灸之父法国外交官苏烈、德国汉学家兼中医大家满晰博等西方中医大伽等在内的7个专题展区，整理和展出铜人明堂图、针灸金针、针灸铜人、《针灸大成》等中医古籍、照片、通关文牒、与中国官员的往来信函、拜贴、手稿、书信、期刊、报纸、中国古代文学译著、关键人物针灸专著、档案等具有重要价值和意义的珍档近3000件，具有较高的文物价值和史料价值，目前博物馆有国有珍贵文物6件，其中国家一级珍贵文物1件、三级珍贵文物5件。

　　“科学技术部西南信息中心查新中心云南中医药大学工作站”落户在图书馆，工作站在面向在面向全省开展科技查新和论文查收查引服务的同时，还可根据学校或者读者（委托人）的调研目的的需求，以学科为对象，通过对学科相关事实与数据的调研，例如借助对目标学科的Web of Science、中文社会科学引文索引（CSSCI）等发文量、各类排行榜排名情况，官方评估情况以及师资、培养等情况的调研，结合多种分析工具及评价方法，设计评价比较指标体系，对学科的现状、发展概况等进行梳理分析，并根据要求以专题报告的形式推展学科服务。

　　图书馆目前有国家中医药管理局重点学科1个、校级培育学科1个，硕士学位授权点1个，孔子学院总部基地1个，承担着学校公共课《文献信息检索》。

　　图书馆目前下设党政办公室、采编部、读者服务部、参考咨询与特藏服务部（文献信息教研室）、信息技术部、国际（西学）中医文化推广研究基地秘书处（中医西学研究所）六个业务部门。在职在编人员23人，其中高级职称15人，中级职称7人，初级职称及以下1人。